La gestión de becas ante los diferentes organismos que las otorgan, requieren que la calificación promedio de aprovechamiento general en los estudios de licenciatura sea superior a la mínima de ocho puntos sobre diez (8.0 /10.0). Sin embargo, este requisito esta sujeto a cambio sin previo aviso.

Para alumnos nacionales y extranjeros el programa de maestría y doctorado (con antecedes de maestría) en Ciencias del Agua cuenta con becas económicas por parte del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), para los aspirantes que reúnan el perfil deseado, ya que el programa se encuentra reconocido en el Programa Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC).

El Consejo Mexiquense de Ciencia y Tecnología (COMECyT) ofrece apoyo económico mensual dirigido a profesionistas inscritos en programas presenciales de posgrado en las modalidades de especialidad, maestría y doctorado para continuar con sus estudios.